怀孕后进行药物流产的最佳时间通常是在停经49天(即孕7周)以内，具体来说，以下时间段被认为是药流较为合适的时间窗口：

一、最佳时间范围

孕35天到49天：

在这个阶段，孕囊大小适中，既不过小也不过大，便于观察和确认是否成功排出。

药物流产的成功率较高，且对女性的身体损伤相对较小。

孕5-6周：

从孕周来看，孕5-6周也是药物流产的一个较佳时间段。此时胎囊相对较小，对药物比较敏感，流产的成功率也会相应提高。

二、具体时间点的考虑

不宜过早：如果怀孕时间过短(如停经35天以内)，孕囊可能还未在宫腔内明显显现，此时进行药物流产可能无法准确判断孕囊是否排出。

不宜过晚：如果怀孕时间超过49天，孕囊会比较大，容易导致出血量增加，且药物流产的成功率会降低。此时可能需要考虑其他流产方式，如人工流产。

三、其他注意事项

年龄限制：药物流产通常适用于年龄不超过40岁的健康女性。

身体检查：在进行药物流产前，女性需要进行全面的身体检查，确保没有严重的全身性疾病、药物过敏史或药物禁忌症等。

B超检查：通过B超检查可以确认孕囊的大小和位置，从而判断是否适合进行药物流产。

医生指导：药物流产必须在医生的指导下进行，以确保安全有效。医生会根据女性的具体情况(如孕囊大小、身体状况等)来制定个性化的流产方案。

综上所述，怀孕后进行药物流产的最佳时间通常是在停经49天以内，特别是孕35天到49天之间。但具体时间还需根据女性的身体状况和孕囊大小等因素来综合考虑。在进行药物流产前，务必进行全面的身体检查和咨询专业医生的意见。